脑血栓形成的治疗主要包括三部分，包括急性期的治疗，很多患者在急性期会出现肢体的瘫痪、言语障碍、语言障碍、眩晕、恶心、呕吐，甚至有可能出现昏迷。如果没有溶栓禁忌症，可以选择溶栓治疗，在发病4.5小时之内可以选择阿替普酶溶栓，在发病6小时之内可以选择尿激酶溶栓。如果发病超过6小时，就已经错过溶栓时间窗，不适合进行溶栓，可以选择应用改善循环、预防血栓、脑保护的药物进行治疗。还有一部分患者可以选择取栓，一些外科的介入治疗方法。
还有康复期的恢复治疗，这个时候药物治疗就是辅助的，不是主要的治疗方案，需要用一些针灸、理疗、康复的康复方案。还有危险因素的控制，在有脑血栓形成的患者中，很大一部分人合并高血压、高血糖、高血脂，这样的患者容易反复出现脑血栓的形成，所以血压、血糖、血脂要定期监测，同时要用药治疗，了解自己药物的疗效，避免脑血栓反复形成。
还有康复期的恢复治疗，这个时候药物治疗就是辅助的，不是主要的治疗方案，需要用一些针灸、理疗、康复的康复方案。还有危险因素的控制，在有脑血栓形成的患者中，很大一部分人合并高血压、高血糖、高血脂，这样的患者容易反复出现脑血栓的形成，所以血压、血糖、血脂要定期监测，同时要用药治疗，了解自己药物的疗效，避免脑血栓反复形成。