1、沙眼衣原体肺炎：沙眼衣原体肺炎主要见于2~12周新生儿和婴儿，常见症状有气急、阵发性咳嗽、咳嗽后发绀，甚至窒息。通常不发热，肺部可闻及啰音及少量哮鸣音。
2、鹦鹉热肺炎：鹦鹉热肺炎为累及单核―吞噬细胞系统的系统性感染。潜伏期7~14d，可出现突发寒战，发热(可高达40℃)，头痛、肌肉疼痛，剧烈关节痛。患者可有咳嗽，多以干咳为主，疾病早期即可出现。
3、肺炎衣原体肺炎：尽管急性感染多见于儿童时期，但是大多数支原体肺炎发生于成人，特别是老年人。可出现无发热的相对轻微的肺炎。临床症状无特异性，潜伏期15~23d。较为特征性的症状为干咳伴有咽痛，声音嘶哑。