目前针对幻肢痛的治疗仍是一个难题，尚无确切有效的治疗方式，对于偶发、轻微的幻肢痛患者，可以不作特殊治疗，其随时间增长，往往自行逐渐消失。针对持续、频繁、严重的幻肢痛，主要采用物理治疗、心理治疗、手术治疗等方式，患者治疗周期一般为6~24个月。
一、药物治疗
治疗幻肢痛的药物主要包括三环类抗抑郁药、阿片类药物、惊厥药、NMDA受体拮抗剂、降钙素、神经-免疫-内分泌系统调节剂等几类，但疗效仍存在较大争议。
1、三环类抗抑郁药：如帕罗西汀、氟西汀、西酞普兰、舍曲林等，特别适用。
2、阿片类药物：如吗啡、哌替啶等，可显著地提高患者的生活质量，是老年幻肢痛患者的首选用药，但阿片类药物容易上瘾，且易产生便秘等副作用，临床应用较少。
3、惊厥药：常用的药物有卡马西平、加巴喷丁、苯妥英钠等，对幻肢痛有明显的缓解作用，但长期服用易产生耐药性。
4、N-甲基-D-天冬氨酸受体受体拮抗剂：目前常用的药物为美金刚、右美沙芬和氯胺酮等，但目前疗效尚不确切，还需大量试验进一步证实N-甲基-D-天冬氨酸受体拮抗剂是否对幻肢痛有疗效。
5、降钙素：相关研究显示降钙素与N-甲基-D-天冬氨酸受体拮抗剂氯胺酮，两者联合使用可以缓解50%幻肢痛病人的疼痛。
6、神经-免疫-内分泌系统调节剂：代表药物是恩再适，有缓解幻肢痛的疗效，不易产生耐药性，副作用比较小。
二、手术治疗
外科手术治疗幻肢痛的方法有残肢端修整术、脊髓前外侧切断术、丘脑切开术、脊神经根入口损毁术、颅内刺激术、和交感神经切除术等。其机制就是通过外科手术毁损痛觉刺激传入的某个环节，甚至痛觉中枢，来达到缓解疼痛的目的。但大多只具有短期疗效，长期易复发，而且创伤大，并发症多，因此，外科手术疗法在治疗幻肢痛方面具有一定的局限性。
三、物理治疗
经皮神经刺激疗法、脉冲电刺激疗法、磁疗和蜡疗、干扰电疗、按摩、水疗等，可以通过脑干激活脊髓背侧角感受疼痛神经元，可以缓解搏动样和压迫性幻肢痛。
四、心理治疗
截肢患者可出现各种情绪、心理紊论，比如失眠、寡言、多虑、忧郁、有轻生想法等不良情绪，可利用催眠、松弛、合理情绪疗法等心理治疗，不仅可以有效缓解幻肢痛，而且可以减少压力和抑郁。
五、其他治疗
1、神经阻滞疗法：神经阻滞是临床上治疗幻肢痛的常用方法之一，包括外周神经阻滞、交感神经节阻滞、硬膜外或蛛网膜下腔阻滞等方法。
2、电休克疗法：电休克疗法是借助电休克设备，在短暂时间内用微弱、适量的电流刺激患者脑部，让患者的大脑皮层放电，引起患者脑部神经内部变化，从而达到治疗幻肢痛的目的。但电休克疗法会给患者带来认知功能损伤，还需试验进一步证实电休克疗法在人体上使用的安全性。
3、穿戴假肢：尽早穿戴假肢可减轻幻肢痛，加强运动疗法，以期传送新末梢部的脉冲。
一、药物治疗
治疗幻肢痛的药物主要包括三环类抗抑郁药、阿片类药物、惊厥药、NMDA受体拮抗剂、降钙素、神经-免疫-内分泌系统调节剂等几类，但疗效仍存在较大争议。
1、三环类抗抑郁药：如帕罗西汀、氟西汀、西酞普兰、舍曲林等，特别适用。
2、阿片类药物：如吗啡、哌替啶等，可显著地提高患者的生活质量，是老年幻肢痛患者的首选用药，但阿片类药物容易上瘾，且易产生便秘等副作用，临床应用较少。
3、惊厥药：常用的药物有卡马西平、加巴喷丁、苯妥英钠等，对幻肢痛有明显的缓解作用，但长期服用易产生耐药性。
4、N-甲基-D-天冬氨酸受体受体拮抗剂：目前常用的药物为美金刚、右美沙芬和氯胺酮等，但目前疗效尚不确切，还需大量试验进一步证实N-甲基-D-天冬氨酸受体拮抗剂是否对幻肢痛有疗效。
5、降钙素：相关研究显示降钙素与N-甲基-D-天冬氨酸受体拮抗剂氯胺酮，两者联合使用可以缓解50%幻肢痛病人的疼痛。
6、神经-免疫-内分泌系统调节剂：代表药物是恩再适，有缓解幻肢痛的疗效，不易产生耐药性，副作用比较小。
二、手术治疗
外科手术治疗幻肢痛的方法有残肢端修整术、脊髓前外侧切断术、丘脑切开术、脊神经根入口损毁术、颅内刺激术、和交感神经切除术等。其机制就是通过外科手术毁损痛觉刺激传入的某个环节，甚至痛觉中枢，来达到缓解疼痛的目的。但大多只具有短期疗效，长期易复发，而且创伤大，并发症多，因此，外科手术疗法在治疗幻肢痛方面具有一定的局限性。
三、物理治疗
经皮神经刺激疗法、脉冲电刺激疗法、磁疗和蜡疗、干扰电疗、按摩、水疗等，可以通过脑干激活脊髓背侧角感受疼痛神经元，可以缓解搏动样和压迫性幻肢痛。
四、心理治疗
截肢患者可出现各种情绪、心理紊论，比如失眠、寡言、多虑、忧郁、有轻生想法等不良情绪，可利用催眠、松弛、合理情绪疗法等心理治疗，不仅可以有效缓解幻肢痛，而且可以减少压力和抑郁。
五、其他治疗
1、神经阻滞疗法：神经阻滞是临床上治疗幻肢痛的常用方法之一，包括外周神经阻滞、交感神经节阻滞、硬膜外或蛛网膜下腔阻滞等方法。
2、电休克疗法：电休克疗法是借助电休克设备，在短暂时间内用微弱、适量的电流刺激患者脑部，让患者的大脑皮层放电，引起患者脑部神经内部变化，从而达到治疗幻肢痛的目的。但电休克疗法会给患者带来认知功能损伤，还需试验进一步证实电休克疗法在人体上使用的安全性。
3、穿戴假肢：尽早穿戴假肢可减轻幻肢痛，加强运动疗法，以期传送新末梢部的脉冲。