肠结核的治疗目的是消除症状，改善全身情况，促使病灶愈合及防治并发症，强调早期治疗，因为肠结核早期病变是可逆的。
一、休息与营养，休息与营养，可以加强患者的抵抗力，是治疗的基础。
二、抗结核的药物，抗结核药是本病治疗的关键，药物的选择、用法、疗程同肺结核，应该遵循“早期、规则、联合、适量、全程的治疗原则。强化期，异烟肼300mg每日1次，利福平600mg每日1次，吡嗪酰胺500mg每日3次，链霉素750mg或乙胺丁醇750-1000mg每日1次，共2-3个月，必要时延长疗程，继续期异烟肼、利福平每日1次顿服，总疗程1-1.5年，如果疗效欠佳，考虑耐药的情况，可以应用二线抗结核药物。
三、对症处理和手术治疗，腹痛可以用颠茄片、阿托品或其他抗胆碱药物，不完全性肠梗阻有时需行胃肠减压，并纠正水、电解质的紊乱，有贫血及维生素缺乏症表现的患者应对症用药。
手术治疗主要限于完全性肠梗阻或部分性肠梗阻，经内科治疗未见好转者，急性肠穿孔引起的粪瘘经保守治疗未见改善者 ，大量肠道出血经积极抢救未能止血者。以上为肠结核的治疗方案。
一、休息与营养，休息与营养，可以加强患者的抵抗力，是治疗的基础。
二、抗结核的药物，抗结核药是本病治疗的关键，药物的选择、用法、疗程同肺结核，应该遵循“早期、规则、联合、适量、全程的治疗原则。强化期，异烟肼300mg每日1次，利福平600mg每日1次，吡嗪酰胺500mg每日3次，链霉素750mg或乙胺丁醇750-1000mg每日1次，共2-3个月，必要时延长疗程，继续期异烟肼、利福平每日1次顿服，总疗程1-1.5年，如果疗效欠佳，考虑耐药的情况，可以应用二线抗结核药物。
三、对症处理和手术治疗，腹痛可以用颠茄片、阿托品或其他抗胆碱药物，不完全性肠梗阻有时需行胃肠减压，并纠正水、电解质的紊乱，有贫血及维生素缺乏症表现的患者应对症用药。
手术治疗主要限于完全性肠梗阻或部分性肠梗阻，经内科治疗未见好转者，急性肠穿孔引起的粪瘘经保守治疗未见改善者 ，大量肠道出血经积极抢救未能止血者。以上为肠结核的治疗方案。