肠胃炎症状较轻者,只需卧床休息,并饮用足量的水分,可口服补液盐溶液,即使有呕吐也要尽量多喝水。哺乳期的婴儿,应继续哺乳,如果呕吐和腹泻持续时间较长,会严重脱水,有必要进行静脉补液。呕吐剧烈时,可加用止吐药。如果腹泻持续时间超过24-48小时,并且没有迹象表明有更严重的细菌感染,可加用止泻药。通常,儿童不建议使用止吐药和止泻药,由于抗生素可能会引起腹泻或促进耐药菌生长,即使胃肠炎的致病菌已经明确,抗生素通常也不建议使用。但是某些病原菌,如弯曲杆菌、霍乱弧菌等感染或者患者有腹泻,可使用抗生素。对于病毒感染所致的胃肠炎,抗生素并无效果。寄生虫感染所致的肠胃炎,需要使用抗寄生虫药物治疗。

