小儿肠套叠的典型症状是阵发性的腹痛、便血和腹部肿块，被称为肠道叠三联症。既往肥胖的婴儿，如果突然发生剧烈、有规律的阵发性绞痛，而且每次腹部绞痛的持续时间为15-20分钟。由于婴儿不能自主的描述他的症状，出现腹痛的时候常表现为阵发性的哭闹，可反复发作。肠套叠发生时，跟随小肠套入相邻肠管内的还有小肠的系膜，而小肠系膜内有小肠的血管，随着肠管的蠕动，被套入的肠管会越来越多，系膜内的血管，极易受到压迫。
当小肠出现缺血时，肠黏膜坏死、脱落以及出血，可以表现为便血，婴儿的血便酷似果酱，所以又称为果酱样大便。发生肠道叠的小肠，由于是肠管套肠管，因此这段小肠偏粗、偏硬，婴儿的肚皮比较薄，约有60%的患儿在触摸的时候可以出摸到腊肠样的肿块。在实际的临床中，仅有少数的孩子出现典型的肠道叠三联症，大多数孩子仅有1-2个典型的症状。
当小肠出现缺血时，肠黏膜坏死、脱落以及出血，可以表现为便血，婴儿的血便酷似果酱，所以又称为果酱样大便。发生肠道叠的小肠，由于是肠管套肠管，因此这段小肠偏粗、偏硬，婴儿的肚皮比较薄，约有60%的患儿在触摸的时候可以出摸到腊肠样的肿块。在实际的临床中，仅有少数的孩子出现典型的肠道叠三联症，大多数孩子仅有1-2个典型的症状。