宝宝打的疫苗免费与自费的区别，主要是免费的疫苗属于国家计划内的，就是宝宝必须要执行的计划免疫，要求宝宝必须在规定时间接种完成的计划疫苗，不论宝宝体质强弱，没有特殊的遗传代谢性疾病或者特殊紧急的情况，都需要接种。而自费的疫苗属于二类疫苗，是根据宝宝自身体质，还有家庭的经济状况，自愿接种疫苗，不做强制要求。二类疫苗最好是在规定的时间内安排接种，不能提前。但是由于疾病的原因，不能接种的时候可以推迟补种，并且要填写好预防接种卡，入学的时候都要检查。
二类疫苗虽然属于自愿的，但是有免疫缺陷的宝宝也是需要预防接种的，不是免费的一类疫苗比自费在二类疫苗更重要。有些疫苗如果是经济情况允许，宝宝身体情况也允许，二类疫苗自费接种更好，比如肺炎疫苗、轮状病毒疫苗等都很好的。如果接种了疫苗，宝宝发病就减少，重症的发病率也会降低。
二类疫苗虽然属于自愿的，但是有免疫缺陷的宝宝也是需要预防接种的，不是免费的一类疫苗比自费在二类疫苗更重要。有些疫苗如果是经济情况允许，宝宝身体情况也允许，二类疫苗自费接种更好，比如肺炎疫苗、轮状病毒疫苗等都很好的。如果接种了疫苗，宝宝发病就减少，重症的发病率也会降低。