脑炎能否治愈与疾病类型相关，如单纯疱疹病毒性脑炎患者，其早期死亡率达40%-70%左右。一般病毒性脑膜炎、脑炎，属无菌性脑炎，预后相对较好。神经梅毒类脑炎，则预后较差，如艾滋病相关脑炎，患者可在一年内死亡。

此外，由于当前医疗技术水平的提高，脑炎患者经积极抗病毒治疗后，死亡率较前明显下降，但可有癫痫发作、头痛、认知功能障碍等后遗症。