巨结肠手术并发症有以下几种：

1、便秘：术前已便秘，不能正常排便，术后仍不能正常排便；

2、肠炎：肠炎是巨结肠特殊并发症，又称巨结肠相关性肠炎，肠炎可发生在术前，也可发生在术后。临床表现为高烧、腹胀、爆发性水样泻、大便恶臭无比。通过X线平片可观察出肠管扩张，肠黏膜不规则、不光滑，肠腔有大量积液等现象；

3、污便：常有小量粪便和粪汁玷污内裤。