滴虫性阴道炎治疗原则遵循夫妻双方同治。阴道毛滴虫通常于厌氧环境下滋生，一般用抗厌氧菌类药物，常用甲硝唑、替硝唑、奥硝唑等。

最早使用口服甲硝唑类药物，对胃肠道有刺激症状，采取早晚各两片连续服一周，亦可采取一次服十片，但对胃肠道刺激较重，需根据个人情况选择。局部用药，常用甲硝唑的泡腾片或者双唑泰，还可以选择中成药的栓剂，保妇康栓、康妇凝胶等。