磨骨手术通常没有明显的后遗症。如操作失误，器械划伤面部、口角、软组织，损伤神经，划破血管，可导致较大的后遗症。如操作不当，可使下颌骨、上颌骨或颅骨发生骨折，尤其是面部颞下颌关节。当面部颞下颌关节骨折时，使得张口受限、面部肌肉瘫痪，导致面瘫，口角歪斜等严重后遗症，因此磨骨手术风险较大，对医生资质要求较高。