阴茎扁宽和阴茎的解剖结构有关。阴茎体由三个海绵体组成，背侧两个阴茎海绵体并排排列，腹侧中央有一个尿道海绵体。在阴茎疲软的情况下，阴茎体呈接近圆柱体样，略显扁宽。当阴茎勃起时，双侧阴茎海绵体充血增粗变硬，尿道海绵体仅轻微的充血，因此使阴茎左右径增大明显，而前后径仅轻微增大，从而使阴茎呈更加明显的扁宽形状。