肛瘘的手术费，根据位置的高低以，及病情复杂程度不同而治疗费用不同。如果是单纯低位肛瘘，一般治疗费用在5000块钱左右，其包括术前的相关辅助检查手术费用，如果是复杂性肛瘘，需要行肛瘘挂线术，严重时还得需要2次或多次手术治疗，治疗费用在1万块钱左右，术后可以应用高锰酸钾温水坐浴，口服消炎药，加强创面换药，预防假性愈合发生。