甲状腺功能检查包括游离三碘甲状腺原氨酸、游离甲状腺素及促甲状腺激素、抗甲状腺过氧化物酶抗体、抗甲状腺球蛋白抗体、促甲状腺受体抗体。三碘甲状腺原氨酸及游离甲状腺素升高提示甲亢。这两项降低，提示甲减。目前游离三碘甲状腺原氨酸及游离甲状腺素一般不受其他因素的影响，是目前诊断甲亢、甲减常用化验指标。促甲状腺受体抗体在甲亢诊断中有重要的意义，也是治疗结束时需查的项目。抗甲状腺过氧化物酶抗体及球蛋白抗体是自身免疫相关甲状腺疾病的重要依据。