怀孕53天胎芽应该在11mm左右，这是月经规律孕妇正常受孕的情况。

如果平时月经不规律，或不是在正常的受孕时间，也就是说在异常排卵时受孕，要根据早孕时的盆腔超声检查的结果，以及末次月经的第一天来综合推算。同时要明确胚胎发育与停经月份是否相符，还可以根据血HCG和血孕酮值来推算。总之，不可以单独看停经天数来确定胎芽的大小，要综合推算。