丙肝病毒基因组在结构和表型特征上与人黄病毒相类似，故将其归为黄病毒科。丙肝病毒为单链正股RNA病毒。丙肝病毒具有显著的异源性和高度的可变性。对已知全部基因组序列的丙肝病毒株进行分析比较其核苷酸和氨基酸序列存在较大的差异。丙肝病毒的传染源主要是急性病急性病程型和无症状的亚临床病人，慢性病人和临床病毒携带者。主要通过血液传播，母婴垂直传播，日常接触和性接触传播。