新月体性肾小球肾炎的主要病理改变为包曼囊新月体形成。肾脏体积常较正常的增大，光镜下可见肾小囊腔内有大新月体形成，病变早期可为细胞新月体，后期为纤维新月体。细胞新月体是指新月体的组成成分均为细胞成分，病变由增生的壁层上皮细胞、单核巨噬细胞、甚至炎性细胞组成，纤维新月体是指以胶原成分为主的新月体。另外还可见内皮细胞和系膜细胞的增生及IgG、C3的沉积等。