欣康单硝酸异山梨酯最常见的副作用是头晕、头痛，这种不良反应在服药初期发生，常常有血压的降低并伴有反射性的脉率增加以及发力、头晕的感觉，有时会有恶心、呕吐、瞬间皮肤发热和皮肤过敏，且缓释片中的发生率比普通片高，一般持续用药症状会消失。需注意的是由于单硝酸异山梨酯的扩血管作用，该药物禁止与西地那非合用，有可能引起严重的低血压而导致致命性的并发症（如心肌梗死）。也不能在服药期间饮酒，如果饮酒会增加发生低血压和昏厥的风险。