临床中中医全科包含的范围比中医内科更广泛。中医全科包含中医内科，同时包含中医外科、中医妇科、中医儿科、中医皮肤科、中医老年科、中医神经科、中医心理科，以及针灸理疗康复科等。而中医内科一般主要是针对内科疾病，可以细分为中医呼吸内科、中医心血管内科、中医消化内科、中医肾内科、中医内分泌内科、中医血液内科等。

中医全科和中医内科有各自的优势。中医全科的优势在于患者的就诊可能更便捷，因此中医全科一般存在于社区或者基层的医疗单位，患者的病情较轻，在中医全科可以得到全方位的治疗。而中医内科的优点在于专科性质较强，因此科室对于本专业的进展和药物更新比较及时，更为专业，比较适合于明确有专科疾病的患者就诊，如中风、消渴病等疾病，一般三甲的综合医院都有中医内科。