真菌荧光检测主要适用于痰液、尿液、毛发、皮屑等，主要检查是否存在菌丝、孢子、真菌等，但不能确定具体的真菌菌种，想要确定具体的真菌菌种通常需要依靠培养检查。医生会根据检查结果，结合患者的临床症状进行进一步确诊。

真菌荧光检测是指在密封的暗室里，在滤过紫外线灯的照射下，可以看见某些真菌会产生不同颜色的荧光，再根据荧光色彩的不同进行判断，在临床上应用较多。常见进行荧光检查真菌有新型隐球菌、孢子丝菌、副球孢子菌、着色真菌等，通常以孢子形态存在，还有念珠菌、曲霉菌、毛霉菌等，在组织内以菌丝形态存在，而放线菌等以颗粒形式存在，在真菌荧光检测中，都可以看到明显的显色。但若确定菌种需要通过培养检查，部分病原性真菌如隐球菌，一次性培养就可以确诊，而很多条件致病菌如念珠菌、曲霉菌等，通常需要多次培养才能够确诊。

临床上常见的是浅部真菌，如皮毛甲癣菌组，主要侵犯的是表皮毛发甲板，如紫色毛癣菌、红色毛癣菌等，在真菌荧光中能看到菌丝，患者常表现为发痒、发胀等症状。另外，皮毛癣菌种主要侵犯表皮和毛发，可能会造成患者出现头癣、体癣等情况，可表现为小疙瘩、小水泡等症状。