瞳孔异色症一般指虹膜异色症，可能是生理因素引起的，还可能是病理因素导致，病理因素包括虹膜炎、虹膜角膜内皮综合征等，需要及时就诊。
一、生理因素：
瞳孔的颜色是由虹膜色素多少来决定的，受遗传因素影响，如果家族中某位成员的眼睛属于异色，即虹膜呈现不同的颜色，可能其后代的眼睛也是异色的，表现为虹膜异色症的现象，是正常的生理情况，不会影响生活，一般不用特殊处理。
二、病理因素：
1、虹膜炎：如果患者平时不注意眼部卫生引起虹膜炎，患者眼部受到炎症刺激，可能会引起虹膜纹理增粗，以及色素脱失的现象，此时虹膜呈现不同的颜色，表现为虹膜异色症的现象，有时还会伴有眼部肿胀、视力下降等情况，一般可以遵医嘱使用氟米龙滴眼液、醋酸泼尼松龙滴眼液等药物缓解病情；
2、虹膜角膜内皮综合征：目前临床上发病原因不是很明确，可能是由于虹膜基础炎症，以及神经嵴细胞分化异常等情况引起。虹膜角膜内皮综合征一般会导致虹膜周边粘连、萎缩，也会影响到虹膜的颜色，出现虹膜异色症，一般需要进行角膜移植来缓解。