通常用质量合格的保温杯喝水对人体无害，但若使用不合格的保温杯喝水，则会对人体造成一定伤害。保温杯的杯胆和杯身的真空绝热层能够延缓散热，从而达到保温目的。
劣质保温杯内胆的不锈钢质量不过关，可能含有较多对人体有害的重金属元素，如铅、镉等。当不合格的内胆和水结合，金属毒素可能会析出，有毒的金属物质会给人体带来伤害，长期食用甚至可能导致重金属中毒症状，出现厌食、间歇性腹痛、便秘、偶发呕吐等症状。此外，保温杯内胆容易被腐蚀、生锈，产生腐蚀物，容易滋生细菌，从而影响消化功能和呼吸系统健康。
在日常生活中要选择正规品牌的保温杯，选择食用级别的不锈钢材质内胆，避免劣质保温杯给人体带来的伤害。同时用保温杯喝水时还需保证水的质量，尽量喝煮沸并且没有受到污染的水。自来水里含有不少杂质和细菌，若未经高温消毒，饮用后可能会引起胃肠道症状如腹痛、腹泻等。